Protein–RNA interactions for Protein: P11277

SPTB, Spectrin beta chain, erythrocytic, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBP11277 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPTBP11277 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPTBP11277 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPTBP11277 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPTBP11277 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPTBP11277 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPTBP11277 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPTBP11277 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPTBP11277 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPTBP11277 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPTBP11277 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPTBP11277 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPTBP11277 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPTBP11277 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPTBP11277 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SPTBP11277 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SPTBP11277 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPTBP11277 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SPTBP11277 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPTBP11277 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPTBP11277 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPTBP11277 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPTBP11277 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SPTBP11277 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SPTBP11277 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPTBP11277 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPTBP11277 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPTBP11277 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPTBP11277 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SPTBP11277 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPTBP11277 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPTBP11277 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPTBP11277 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPTBP11277 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPTBP11277 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPTBP11277 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPTBP11277 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPTBP11277 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPTBP11277 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPTBP11277 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPTBP11277 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPTBP11277 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPTBP11277 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPTBP11277 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPTBP11277 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPTBP11277 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPTBP11277 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SPTBP11277 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPTBP11277 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPTBP11277 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPTBP11277 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPTBP11277 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SPTBP11277 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPTBP11277 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPTBP11277 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPTBP11277 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPTBP11277 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SPTBP11277 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPTBP11277 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPTBP11277 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPTBP11277 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPTBP11277 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPTBP11277 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPTBP11277 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPTBP11277 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPTBP11277 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPTBP11277 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPTBP11277 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPTBP11277 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPTBP11277 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPTBP11277 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPTBP11277 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPTBP11277 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPTBP11277 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPTBP11277 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPTBP11277 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPTBP11277 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPTBP11277 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPTBP11277 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPTBP11277 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPTBP11277 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPTBP11277 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPTBP11277 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPTBP11277 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPTBP11277 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPTBP11277 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPTBP11277 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SPTBP11277 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPTBP11277 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPTBP11277 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPTBP11277 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPTBP11277 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPTBP11277 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPTBP11277 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPTBP11277 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPTBP11277 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPTBP11277 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPTBP11277 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPTBP11277 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPTBP11277 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms