Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RARBP10826 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
RARBP10826 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RARBP10826 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RARBP10826 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RARBP10826 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RARBP10826 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RARBP10826 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
RARBP10826 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
RARBP10826 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
RARBP10826 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RARBP10826 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RARBP10826 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RARBP10826 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RARBP10826 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RARBP10826 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RARBP10826 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RARBP10826 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RARBP10826 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RARBP10826 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RARBP10826 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RARBP10826 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RARBP10826 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RARBP10826 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RARBP10826 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RARBP10826 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RARBP10826 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RARBP10826 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RARBP10826 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RARBP10826 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RARBP10826 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RARBP10826 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RARBP10826 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RARBP10826 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RARBP10826 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RARBP10826 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RARBP10826 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RARBP10826 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RARBP10826 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RARBP10826 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RARBP10826 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RARBP10826 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RARBP10826 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
RARBP10826 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RARBP10826 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
RARBP10826 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RARBP10826 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RARBP10826 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RARBP10826 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RARBP10826 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RARBP10826 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
RARBP10826 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RARBP10826 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RARBP10826 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RARBP10826 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RARBP10826 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RARBP10826 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
RARBP10826 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RARBP10826 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RARBP10826 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RARBP10826 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RARBP10826 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RARBP10826 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RARBP10826 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
RARBP10826 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RARBP10826 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
RARBP10826 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RARBP10826 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RARBP10826 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RARBP10826 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RARBP10826 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
RARBP10826 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RARBP10826 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RARBP10826 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RARBP10826 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
RARBP10826 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
RARBP10826 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
RARBP10826 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RARBP10826 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RARBP10826 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RARBP10826 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RARBP10826 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
RARBP10826 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RARBP10826 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
RARBP10826 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
RARBP10826 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RARBP10826 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RARBP10826 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RARBP10826 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RARBP10826 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RARBP10826 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RARBP10826 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RARBP10826 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RARBP10826 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
RARBP10826 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RARBP10826 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RARBP10826 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RARBP10826 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RARBP10826 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RARBP10826 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms