Protein–RNA interactions for Protein: P09919

CSF3, Granulocyte colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3P09919 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CSF3P09919 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSF3P09919 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSF3P09919 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSF3P09919 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSF3P09919 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSF3P09919 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSF3P09919 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSF3P09919 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSF3P09919 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSF3P09919 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSF3P09919 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSF3P09919 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSF3P09919 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSF3P09919 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSF3P09919 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSF3P09919 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSF3P09919 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSF3P09919 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSF3P09919 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSF3P09919 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSF3P09919 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSF3P09919 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSF3P09919 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSF3P09919 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSF3P09919 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSF3P09919 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSF3P09919 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSF3P09919 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSF3P09919 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSF3P09919 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSF3P09919 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSF3P09919 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSF3P09919 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSF3P09919 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSF3P09919 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSF3P09919 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSF3P09919 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSF3P09919 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSF3P09919 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSF3P09919 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSF3P09919 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSF3P09919 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSF3P09919 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSF3P09919 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSF3P09919 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CSF3P09919 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CSF3P09919 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSF3P09919 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSF3P09919 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSF3P09919 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSF3P09919 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSF3P09919 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSF3P09919 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSF3P09919 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSF3P09919 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSF3P09919 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSF3P09919 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSF3P09919 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSF3P09919 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSF3P09919 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSF3P09919 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSF3P09919 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSF3P09919 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSF3P09919 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSF3P09919 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSF3P09919 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSF3P09919 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSF3P09919 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSF3P09919 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSF3P09919 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSF3P09919 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSF3P09919 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSF3P09919 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CSF3P09919 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSF3P09919 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSF3P09919 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSF3P09919 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSF3P09919 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSF3P09919 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSF3P09919 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSF3P09919 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSF3P09919 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSF3P09919 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSF3P09919 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSF3P09919 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CSF3P09919 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSF3P09919 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSF3P09919 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSF3P09919 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSF3P09919 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSF3P09919 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSF3P09919 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSF3P09919 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSF3P09919 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSF3P09919 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSF3P09919 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSF3P09919 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSF3P09919 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSF3P09919 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms