Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKHD1P08F94 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKHD1P08F94 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKHD1P08F94 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKHD1P08F94 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKHD1P08F94 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKHD1P08F94 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKHD1P08F94 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKHD1P08F94 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKHD1P08F94 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PKHD1P08F94 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKHD1P08F94 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKHD1P08F94 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKHD1P08F94 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKHD1P08F94 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PKHD1P08F94 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PKHD1P08F94 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKHD1P08F94 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKHD1P08F94 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKHD1P08F94 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PKHD1P08F94 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKHD1P08F94 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKHD1P08F94 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKHD1P08F94 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKHD1P08F94 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKHD1P08F94 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKHD1P08F94 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKHD1P08F94 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKHD1P08F94 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PKHD1P08F94 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PKHD1P08F94 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKHD1P08F94 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKHD1P08F94 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKHD1P08F94 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKHD1P08F94 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKHD1P08F94 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKHD1P08F94 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKHD1P08F94 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKHD1P08F94 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKHD1P08F94 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKHD1P08F94 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKHD1P08F94 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKHD1P08F94 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKHD1P08F94 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKHD1P08F94 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKHD1P08F94 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKHD1P08F94 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKHD1P08F94 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKHD1P08F94 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKHD1P08F94 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKHD1P08F94 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKHD1P08F94 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKHD1P08F94 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKHD1P08F94 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKHD1P08F94 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKHD1P08F94 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKHD1P08F94 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKHD1P08F94 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKHD1P08F94 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKHD1P08F94 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKHD1P08F94 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PKHD1P08F94 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKHD1P08F94 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKHD1P08F94 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKHD1P08F94 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKHD1P08F94 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PKHD1P08F94 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PKHD1P08F94 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PKHD1P08F94 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKHD1P08F94 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKHD1P08F94 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKHD1P08F94 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKHD1P08F94 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKHD1P08F94 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKHD1P08F94 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKHD1P08F94 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKHD1P08F94 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKHD1P08F94 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKHD1P08F94 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKHD1P08F94 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PKHD1P08F94 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PKHD1P08F94 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PKHD1P08F94 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PKHD1P08F94 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PKHD1P08F94 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PKHD1P08F94 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PKHD1P08F94 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKHD1P08F94 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKHD1P08F94 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PKHD1P08F94 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKHD1P08F94 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKHD1P08F94 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKHD1P08F94 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKHD1P08F94 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKHD1P08F94 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKHD1P08F94 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKHD1P08F94 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKHD1P08F94 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKHD1P08F94 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PKHD1P08F94 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms