Protein–RNA interactions for Protein: P08493

MGP, Matrix Gla protein, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGPP08493 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MGPP08493 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MGPP08493 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MGPP08493 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MGPP08493 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MGPP08493 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MGPP08493 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MGPP08493 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MGPP08493 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MGPP08493 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
MGPP08493 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MGPP08493 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MGPP08493 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MGPP08493 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MGPP08493 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MGPP08493 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
MGPP08493 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MGPP08493 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MGPP08493 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MGPP08493 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MGPP08493 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MGPP08493 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MGPP08493 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MGPP08493 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MGPP08493 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MGPP08493 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MGPP08493 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MGPP08493 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MGPP08493 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MGPP08493 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MGPP08493 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MGPP08493 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MGPP08493 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MGPP08493 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MGPP08493 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MGPP08493 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MGPP08493 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MGPP08493 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MGPP08493 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MGPP08493 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MGPP08493 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MGPP08493 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MGPP08493 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MGPP08493 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MGPP08493 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MGPP08493 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MGPP08493 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MGPP08493 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MGPP08493 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MGPP08493 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MGPP08493 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MGPP08493 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MGPP08493 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
MGPP08493 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MGPP08493 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MGPP08493 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MGPP08493 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MGPP08493 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MGPP08493 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MGPP08493 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MGPP08493 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MGPP08493 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MGPP08493 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MGPP08493 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MGPP08493 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MGPP08493 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MGPP08493 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MGPP08493 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MGPP08493 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MGPP08493 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MGPP08493 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MGPP08493 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MGPP08493 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MGPP08493 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MGPP08493 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MGPP08493 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MGPP08493 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MGPP08493 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MGPP08493 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MGPP08493 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MGPP08493 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MGPP08493 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MGPP08493 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MGPP08493 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MGPP08493 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MGPP08493 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MGPP08493 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MGPP08493 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MGPP08493 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MGPP08493 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MGPP08493 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MGPP08493 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MGPP08493 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MGPP08493 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MGPP08493 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MGPP08493 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MGPP08493 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MGPP08493 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MGPP08493 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MGPP08493 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms