Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOC3P02656 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOC3P02656 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOC3P02656 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOC3P02656 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOC3P02656 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOC3P02656 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOC3P02656 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOC3P02656 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOC3P02656 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOC3P02656 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOC3P02656 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOC3P02656 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOC3P02656 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOC3P02656 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOC3P02656 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOC3P02656 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOC3P02656 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOC3P02656 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOC3P02656 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOC3P02656 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOC3P02656 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOC3P02656 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOC3P02656 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOC3P02656 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOC3P02656 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOC3P02656 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC3P02656 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC3P02656 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC3P02656 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC3P02656 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
APOC3P02656 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOC3P02656 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOC3P02656 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOC3P02656 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOC3P02656 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APOC3P02656 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOC3P02656 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOC3P02656 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOC3P02656 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOC3P02656 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOC3P02656 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOC3P02656 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOC3P02656 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOC3P02656 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOC3P02656 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOC3P02656 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOC3P02656 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOC3P02656 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOC3P02656 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOC3P02656 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOC3P02656 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOC3P02656 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOC3P02656 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOC3P02656 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOC3P02656 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOC3P02656 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOC3P02656 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOC3P02656 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOC3P02656 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOC3P02656 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOC3P02656 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOC3P02656 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOC3P02656 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOC3P02656 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOC3P02656 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOC3P02656 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOC3P02656 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOC3P02656 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOC3P02656 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOC3P02656 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOC3P02656 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOC3P02656 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOC3P02656 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOC3P02656 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOC3P02656 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOC3P02656 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOC3P02656 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOC3P02656 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOC3P02656 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOC3P02656 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOC3P02656 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOC3P02656 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOC3P02656 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOC3P02656 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOC3P02656 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOC3P02656 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
APOC3P02656 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOC3P02656 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOC3P02656 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOC3P02656 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOC3P02656 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOC3P02656 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOC3P02656 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOC3P02656 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOC3P02656 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOC3P02656 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOC3P02656 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
APOC3P02656 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOC3P02656 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms