Protein–RNA interactions for Protein: P00736

C1R, Complement C1r subcomponent, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RP00736 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
C1RP00736 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
C1RP00736 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
C1RP00736 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
C1RP00736 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
C1RP00736 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
C1RP00736 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
C1RP00736 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
C1RP00736 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
C1RP00736 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
C1RP00736 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
C1RP00736 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
C1RP00736 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
C1RP00736 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
C1RP00736 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
C1RP00736 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
C1RP00736 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
C1RP00736 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
C1RP00736 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
C1RP00736 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
C1RP00736 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
C1RP00736 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
C1RP00736 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
C1RP00736 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
C1RP00736 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
C1RP00736 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
C1RP00736 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
C1RP00736 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
C1RP00736 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
C1RP00736 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
C1RP00736 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
C1RP00736 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
C1RP00736 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
C1RP00736 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
C1RP00736 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
C1RP00736 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
C1RP00736 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
C1RP00736 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
C1RP00736 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
C1RP00736 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
C1RP00736 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
C1RP00736 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
C1RP00736 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
C1RP00736 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
C1RP00736 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
C1RP00736 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
C1RP00736 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
C1RP00736 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
C1RP00736 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
C1RP00736 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
C1RP00736 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
C1RP00736 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
C1RP00736 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
C1RP00736 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
C1RP00736 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
C1RP00736 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
C1RP00736 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
C1RP00736 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
C1RP00736 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
C1RP00736 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
C1RP00736 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
C1RP00736 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
C1RP00736 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
C1RP00736 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
C1RP00736 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
C1RP00736 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
C1RP00736 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
C1RP00736 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
C1RP00736 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
C1RP00736 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
C1RP00736 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
C1RP00736 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
C1RP00736 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
C1RP00736 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
C1RP00736 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
C1RP00736 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
C1RP00736 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
C1RP00736 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
C1RP00736 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
C1RP00736 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
C1RP00736 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
C1RP00736 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
C1RP00736 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
C1RP00736 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
C1RP00736 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
C1RP00736 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
C1RP00736 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
C1RP00736 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
C1RP00736 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
C1RP00736 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C1RP00736 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C1RP00736 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C1RP00736 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C1RP00736 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
C1RP00736 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
C1RP00736 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
C1RP00736 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
C1RP00736 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C1RP00736 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C1RP00736 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms