Protein–RNA interactions for Protein: O95674

CDS2, Phosphatidate cytidylyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDS2O95674 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDS2O95674 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDS2O95674 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDS2O95674 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDS2O95674 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDS2O95674 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDS2O95674 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CDS2O95674 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDS2O95674 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDS2O95674 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDS2O95674 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDS2O95674 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDS2O95674 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDS2O95674 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDS2O95674 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDS2O95674 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDS2O95674 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDS2O95674 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDS2O95674 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDS2O95674 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDS2O95674 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDS2O95674 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDS2O95674 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDS2O95674 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDS2O95674 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDS2O95674 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDS2O95674 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDS2O95674 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDS2O95674 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDS2O95674 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDS2O95674 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDS2O95674 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDS2O95674 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDS2O95674 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDS2O95674 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDS2O95674 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDS2O95674 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDS2O95674 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDS2O95674 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDS2O95674 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDS2O95674 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDS2O95674 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDS2O95674 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDS2O95674 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDS2O95674 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDS2O95674 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDS2O95674 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDS2O95674 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDS2O95674 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDS2O95674 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDS2O95674 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDS2O95674 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDS2O95674 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDS2O95674 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDS2O95674 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDS2O95674 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDS2O95674 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDS2O95674 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDS2O95674 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDS2O95674 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDS2O95674 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDS2O95674 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDS2O95674 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDS2O95674 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDS2O95674 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDS2O95674 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDS2O95674 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDS2O95674 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDS2O95674 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDS2O95674 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDS2O95674 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDS2O95674 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDS2O95674 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CDS2O95674 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDS2O95674 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDS2O95674 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDS2O95674 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDS2O95674 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDS2O95674 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDS2O95674 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDS2O95674 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDS2O95674 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDS2O95674 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDS2O95674 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDS2O95674 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDS2O95674 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDS2O95674 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDS2O95674 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDS2O95674 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDS2O95674 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDS2O95674 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDS2O95674 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDS2O95674 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDS2O95674 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDS2O95674 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDS2O95674 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDS2O95674 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDS2O95674 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDS2O95674 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDS2O95674 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms