Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
RAPGEF3O95398 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
RAPGEF3O95398 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
RAPGEF3O95398 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
RAPGEF3O95398 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC42.32■■■■■ 4.37
RAPGEF3O95398 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
RAPGEF3O95398 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
RAPGEF3O95398 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
RAPGEF3O95398 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC42.27■■■■■ 4.36
RAPGEF3O95398 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC42.26■■■■■ 4.36
RAPGEF3O95398 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
RAPGEF3O95398 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
RAPGEF3O95398 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC42.25■■■■■ 4.35
RAPGEF3O95398 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
RAPGEF3O95398 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
RAPGEF3O95398 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC42.21■■■■■ 4.35
RAPGEF3O95398 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
RAPGEF3O95398 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
RAPGEF3O95398 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
RAPGEF3O95398 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
RAPGEF3O95398 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
RAPGEF3O95398 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC42.16■■■■■ 4.34
RAPGEF3O95398 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
RAPGEF3O95398 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
RAPGEF3O95398 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC42.12■■■■■ 4.33
RAPGEF3O95398 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
RAPGEF3O95398 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
RAPGEF3O95398 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC42.07■■■■■ 4.33
RAPGEF3O95398 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.33
RAPGEF3O95398 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
RAPGEF3O95398 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC42.06■■■■■ 4.32
RAPGEF3O95398 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
RAPGEF3O95398 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC42.05■■■■■ 4.32
RAPGEF3O95398 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
RAPGEF3O95398 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
RAPGEF3O95398 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC42.03■■■■■ 4.32
RAPGEF3O95398 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
RAPGEF3O95398 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC42.03■■■■■ 4.32
RAPGEF3O95398 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC42.03■■■■■ 4.32
RAPGEF3O95398 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC42.01■■■■■ 4.32
RAPGEF3O95398 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC42.01■■■■■ 4.32
RAPGEF3O95398 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC42.01■■■■■ 4.32
RAPGEF3O95398 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC42.01■■■■■ 4.32
RAPGEF3O95398 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC42.01■■■■■ 4.32
RAPGEF3O95398 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
RAPGEF3O95398 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
RAPGEF3O95398 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC41.98■■■■■ 4.31
RAPGEF3O95398 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC41.97■■■■■ 4.31
RAPGEF3O95398 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
RAPGEF3O95398 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
RAPGEF3O95398 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
RAPGEF3O95398 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC41.93■■■■■ 4.3
RAPGEF3O95398 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
RAPGEF3O95398 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
RAPGEF3O95398 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.29
RAPGEF3O95398 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
RAPGEF3O95398 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
RAPGEF3O95398 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
RAPGEF3O95398 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC41.81■■■■■ 4.28
RAPGEF3O95398 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
RAPGEF3O95398 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC41.79■■■■■ 4.28
RAPGEF3O95398 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
RAPGEF3O95398 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
RAPGEF3O95398 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC41.77■■■■■ 4.28
RAPGEF3O95398 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
RAPGEF3O95398 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
RAPGEF3O95398 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC41.75■■■■■ 4.27
RAPGEF3O95398 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
RAPGEF3O95398 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
RAPGEF3O95398 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.72■■■■■ 4.27
RAPGEF3O95398 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC41.7■■■■■ 4.27
RAPGEF3O95398 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC41.7■■■■■ 4.27
RAPGEF3O95398 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC41.7■■■■■ 4.27
RAPGEF3O95398 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
RAPGEF3O95398 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC41.68■■■■■ 4.26
RAPGEF3O95398 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
RAPGEF3O95398 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
RAPGEF3O95398 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
RAPGEF3O95398 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
RAPGEF3O95398 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
RAPGEF3O95398 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
RAPGEF3O95398 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.63■■■■■ 4.25
RAPGEF3O95398 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC41.63■■■■■ 4.25
RAPGEF3O95398 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.25
RAPGEF3O95398 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
RAPGEF3O95398 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC41.6■■■■■ 4.25
RAPGEF3O95398 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
RAPGEF3O95398 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
RAPGEF3O95398 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
RAPGEF3O95398 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
RAPGEF3O95398 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC41.59■■■■■ 4.25
RAPGEF3O95398 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.57■■■■■ 4.25
RAPGEF3O95398 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
RAPGEF3O95398 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
RAPGEF3O95398 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
RAPGEF3O95398 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
RAPGEF3O95398 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
RAPGEF3O95398 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
RAPGEF3O95398 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
RAPGEF3O95398 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC41.52■■■■■ 4.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.5 ms