Protein–RNA interactions for Protein: O94906

PRPF6, Pre-mRNA-processing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF6O94906 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRPF6O94906 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRPF6O94906 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRPF6O94906 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRPF6O94906 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
PRPF6O94906 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRPF6O94906 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRPF6O94906 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
PRPF6O94906 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRPF6O94906 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRPF6O94906 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PRPF6O94906 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PRPF6O94906 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PRPF6O94906 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PRPF6O94906 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRPF6O94906 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRPF6O94906 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRPF6O94906 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRPF6O94906 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PRPF6O94906 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRPF6O94906 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRPF6O94906 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRPF6O94906 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRPF6O94906 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRPF6O94906 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRPF6O94906 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRPF6O94906 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRPF6O94906 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRPF6O94906 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRPF6O94906 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRPF6O94906 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRPF6O94906 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRPF6O94906 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRPF6O94906 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PRPF6O94906 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRPF6O94906 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRPF6O94906 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PRPF6O94906 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRPF6O94906 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
PRPF6O94906 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRPF6O94906 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRPF6O94906 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRPF6O94906 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRPF6O94906 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRPF6O94906 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRPF6O94906 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRPF6O94906 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRPF6O94906 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRPF6O94906 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRPF6O94906 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRPF6O94906 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRPF6O94906 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRPF6O94906 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PRPF6O94906 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PRPF6O94906 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PRPF6O94906 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRPF6O94906 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRPF6O94906 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PRPF6O94906 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRPF6O94906 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
PRPF6O94906 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRPF6O94906 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRPF6O94906 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRPF6O94906 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRPF6O94906 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRPF6O94906 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRPF6O94906 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRPF6O94906 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRPF6O94906 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
PRPF6O94906 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRPF6O94906 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRPF6O94906 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRPF6O94906 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRPF6O94906 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRPF6O94906 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRPF6O94906 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRPF6O94906 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRPF6O94906 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRPF6O94906 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRPF6O94906 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRPF6O94906 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRPF6O94906 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRPF6O94906 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRPF6O94906 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRPF6O94906 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRPF6O94906 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRPF6O94906 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRPF6O94906 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRPF6O94906 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRPF6O94906 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRPF6O94906 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRPF6O94906 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRPF6O94906 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRPF6O94906 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRPF6O94906 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRPF6O94906 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRPF6O94906 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRPF6O94906 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRPF6O94906 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRPF6O94906 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms