Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TRMUO75648 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRMUO75648 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRMUO75648 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRMUO75648 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRMUO75648 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRMUO75648 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRMUO75648 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRMUO75648 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRMUO75648 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRMUO75648 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRMUO75648 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRMUO75648 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRMUO75648 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRMUO75648 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRMUO75648 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRMUO75648 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRMUO75648 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRMUO75648 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRMUO75648 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRMUO75648 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRMUO75648 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRMUO75648 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRMUO75648 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRMUO75648 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRMUO75648 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRMUO75648 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRMUO75648 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRMUO75648 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRMUO75648 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRMUO75648 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRMUO75648 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRMUO75648 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRMUO75648 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRMUO75648 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRMUO75648 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRMUO75648 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRMUO75648 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRMUO75648 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRMUO75648 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRMUO75648 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRMUO75648 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRMUO75648 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRMUO75648 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRMUO75648 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRMUO75648 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRMUO75648 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRMUO75648 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRMUO75648 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRMUO75648 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRMUO75648 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRMUO75648 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRMUO75648 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRMUO75648 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRMUO75648 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRMUO75648 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRMUO75648 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRMUO75648 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRMUO75648 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRMUO75648 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRMUO75648 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRMUO75648 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRMUO75648 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRMUO75648 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRMUO75648 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRMUO75648 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRMUO75648 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRMUO75648 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRMUO75648 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRMUO75648 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRMUO75648 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRMUO75648 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRMUO75648 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRMUO75648 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRMUO75648 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRMUO75648 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRMUO75648 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRMUO75648 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRMUO75648 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRMUO75648 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRMUO75648 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRMUO75648 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRMUO75648 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRMUO75648 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRMUO75648 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRMUO75648 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRMUO75648 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TRMUO75648 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRMUO75648 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRMUO75648 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRMUO75648 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRMUO75648 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRMUO75648 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRMUO75648 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRMUO75648 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRMUO75648 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRMUO75648 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRMUO75648 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRMUO75648 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRMUO75648 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms