Protein–RNA interactions for Protein: O75409

HYPM, Huntingtin-interacting protein M, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HYPMO75409 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HYPMO75409 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HYPMO75409 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HYPMO75409 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HYPMO75409 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HYPMO75409 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HYPMO75409 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HYPMO75409 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HYPMO75409 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HYPMO75409 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HYPMO75409 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HYPMO75409 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HYPMO75409 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HYPMO75409 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HYPMO75409 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HYPMO75409 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HYPMO75409 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HYPMO75409 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HYPMO75409 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HYPMO75409 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HYPMO75409 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HYPMO75409 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HYPMO75409 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HYPMO75409 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HYPMO75409 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HYPMO75409 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HYPMO75409 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HYPMO75409 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HYPMO75409 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HYPMO75409 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HYPMO75409 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HYPMO75409 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HYPMO75409 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
HYPMO75409 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HYPMO75409 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HYPMO75409 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HYPMO75409 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HYPMO75409 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HYPMO75409 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HYPMO75409 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HYPMO75409 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HYPMO75409 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HYPMO75409 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HYPMO75409 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HYPMO75409 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HYPMO75409 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HYPMO75409 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HYPMO75409 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HYPMO75409 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HYPMO75409 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HYPMO75409 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HYPMO75409 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HYPMO75409 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HYPMO75409 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HYPMO75409 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HYPMO75409 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HYPMO75409 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HYPMO75409 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HYPMO75409 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HYPMO75409 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HYPMO75409 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HYPMO75409 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HYPMO75409 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HYPMO75409 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HYPMO75409 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HYPMO75409 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HYPMO75409 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HYPMO75409 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HYPMO75409 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HYPMO75409 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HYPMO75409 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HYPMO75409 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HYPMO75409 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HYPMO75409 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HYPMO75409 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HYPMO75409 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HYPMO75409 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HYPMO75409 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HYPMO75409 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HYPMO75409 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HYPMO75409 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HYPMO75409 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HYPMO75409 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HYPMO75409 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HYPMO75409 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HYPMO75409 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HYPMO75409 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HYPMO75409 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HYPMO75409 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HYPMO75409 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HYPMO75409 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HYPMO75409 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HYPMO75409 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HYPMO75409 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HYPMO75409 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HYPMO75409 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HYPMO75409 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HYPMO75409 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HYPMO75409 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HYPMO75409 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms