Protein–RNA interactions for Protein: O75387

SLC43A1, Large neutral amino acids transporter small subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC43A1O75387 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC43A1O75387 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC43A1O75387 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC43A1O75387 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC43A1O75387 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC43A1O75387 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC43A1O75387 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC43A1O75387 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC43A1O75387 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC43A1O75387 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC43A1O75387 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC43A1O75387 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC43A1O75387 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC43A1O75387 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC43A1O75387 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC43A1O75387 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC43A1O75387 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC43A1O75387 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC43A1O75387 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC43A1O75387 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC43A1O75387 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC43A1O75387 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC43A1O75387 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC43A1O75387 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC43A1O75387 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC43A1O75387 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC43A1O75387 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC43A1O75387 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC43A1O75387 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC43A1O75387 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC43A1O75387 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC43A1O75387 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC43A1O75387 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC43A1O75387 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC43A1O75387 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC43A1O75387 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC43A1O75387 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC43A1O75387 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC43A1O75387 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC43A1O75387 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC43A1O75387 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC43A1O75387 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC43A1O75387 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC43A1O75387 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC43A1O75387 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC43A1O75387 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC43A1O75387 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC43A1O75387 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC43A1O75387 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC43A1O75387 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC43A1O75387 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC43A1O75387 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC43A1O75387 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC43A1O75387 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC43A1O75387 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC43A1O75387 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC43A1O75387 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC43A1O75387 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC43A1O75387 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC43A1O75387 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC43A1O75387 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC43A1O75387 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC43A1O75387 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC43A1O75387 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC43A1O75387 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC43A1O75387 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC43A1O75387 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC43A1O75387 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC43A1O75387 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC43A1O75387 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC43A1O75387 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC43A1O75387 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC43A1O75387 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC43A1O75387 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC43A1O75387 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC43A1O75387 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC43A1O75387 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC43A1O75387 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC43A1O75387 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC43A1O75387 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC43A1O75387 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC43A1O75387 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC43A1O75387 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC43A1O75387 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC43A1O75387 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC43A1O75387 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC43A1O75387 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC43A1O75387 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC43A1O75387 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC43A1O75387 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC43A1O75387 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC43A1O75387 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC43A1O75387 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC43A1O75387 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC43A1O75387 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC43A1O75387 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC43A1O75387 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC43A1O75387 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC43A1O75387 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC43A1O75387 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms