Protein–RNA interactions for Protein: O75192

PEX11A, Peroxisomal membrane protein 11A, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11AO75192 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PEX11AO75192 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PEX11AO75192 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PEX11AO75192 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PEX11AO75192 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PEX11AO75192 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PEX11AO75192 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PEX11AO75192 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PEX11AO75192 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PEX11AO75192 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PEX11AO75192 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PEX11AO75192 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PEX11AO75192 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PEX11AO75192 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PEX11AO75192 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PEX11AO75192 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PEX11AO75192 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PEX11AO75192 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PEX11AO75192 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PEX11AO75192 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PEX11AO75192 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PEX11AO75192 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PEX11AO75192 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PEX11AO75192 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PEX11AO75192 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PEX11AO75192 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PEX11AO75192 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PEX11AO75192 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PEX11AO75192 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PEX11AO75192 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PEX11AO75192 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PEX11AO75192 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PEX11AO75192 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PEX11AO75192 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PEX11AO75192 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PEX11AO75192 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PEX11AO75192 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PEX11AO75192 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PEX11AO75192 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PEX11AO75192 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PEX11AO75192 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PEX11AO75192 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PEX11AO75192 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PEX11AO75192 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PEX11AO75192 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PEX11AO75192 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PEX11AO75192 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PEX11AO75192 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PEX11AO75192 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PEX11AO75192 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PEX11AO75192 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PEX11AO75192 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PEX11AO75192 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PEX11AO75192 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PEX11AO75192 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PEX11AO75192 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PEX11AO75192 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PEX11AO75192 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PEX11AO75192 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PEX11AO75192 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PEX11AO75192 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PEX11AO75192 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PEX11AO75192 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PEX11AO75192 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PEX11AO75192 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PEX11AO75192 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PEX11AO75192 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PEX11AO75192 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PEX11AO75192 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PEX11AO75192 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PEX11AO75192 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PEX11AO75192 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PEX11AO75192 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PEX11AO75192 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PEX11AO75192 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PEX11AO75192 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PEX11AO75192 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PEX11AO75192 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PEX11AO75192 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PEX11AO75192 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PEX11AO75192 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PEX11AO75192 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PEX11AO75192 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PEX11AO75192 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PEX11AO75192 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PEX11AO75192 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PEX11AO75192 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PEX11AO75192 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PEX11AO75192 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PEX11AO75192 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PEX11AO75192 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PEX11AO75192 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PEX11AO75192 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PEX11AO75192 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PEX11AO75192 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PEX11AO75192 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PEX11AO75192 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PEX11AO75192 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PEX11AO75192 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PEX11AO75192 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms