Protein–RNA interactions for Protein: O75191

XYLB, Xylulose kinase, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XYLBO75191 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
XYLBO75191 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
XYLBO75191 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
XYLBO75191 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
XYLBO75191 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
XYLBO75191 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
XYLBO75191 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
XYLBO75191 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
XYLBO75191 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
XYLBO75191 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
XYLBO75191 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
XYLBO75191 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
XYLBO75191 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
XYLBO75191 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
XYLBO75191 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
XYLBO75191 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
XYLBO75191 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
XYLBO75191 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
XYLBO75191 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
XYLBO75191 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
XYLBO75191 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
XYLBO75191 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
XYLBO75191 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
XYLBO75191 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
XYLBO75191 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
XYLBO75191 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
XYLBO75191 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
XYLBO75191 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
XYLBO75191 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
XYLBO75191 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
XYLBO75191 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
XYLBO75191 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
XYLBO75191 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
XYLBO75191 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
XYLBO75191 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
XYLBO75191 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
XYLBO75191 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
XYLBO75191 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
XYLBO75191 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
XYLBO75191 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
XYLBO75191 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
XYLBO75191 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
XYLBO75191 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
XYLBO75191 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
XYLBO75191 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
XYLBO75191 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
XYLBO75191 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
XYLBO75191 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
XYLBO75191 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
XYLBO75191 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
XYLBO75191 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
XYLBO75191 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
XYLBO75191 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
XYLBO75191 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
XYLBO75191 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
XYLBO75191 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
XYLBO75191 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
XYLBO75191 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
XYLBO75191 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
XYLBO75191 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
XYLBO75191 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
XYLBO75191 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
XYLBO75191 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
XYLBO75191 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
XYLBO75191 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
XYLBO75191 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
XYLBO75191 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
XYLBO75191 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
XYLBO75191 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
XYLBO75191 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
XYLBO75191 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
XYLBO75191 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
XYLBO75191 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
XYLBO75191 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
XYLBO75191 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
XYLBO75191 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
XYLBO75191 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
XYLBO75191 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
XYLBO75191 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
XYLBO75191 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
XYLBO75191 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
XYLBO75191 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
XYLBO75191 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
XYLBO75191 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
XYLBO75191 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
XYLBO75191 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
XYLBO75191 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
XYLBO75191 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
XYLBO75191 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
XYLBO75191 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
XYLBO75191 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
XYLBO75191 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
XYLBO75191 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
XYLBO75191 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
XYLBO75191 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
XYLBO75191 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
XYLBO75191 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
XYLBO75191 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
XYLBO75191 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
XYLBO75191 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms