Protein–RNA interactions for Protein: O60568

PLOD3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD3O60568 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PLOD3O60568 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLOD3O60568 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLOD3O60568 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PLOD3O60568 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLOD3O60568 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLOD3O60568 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLOD3O60568 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PLOD3O60568 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLOD3O60568 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLOD3O60568 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLOD3O60568 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLOD3O60568 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLOD3O60568 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLOD3O60568 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLOD3O60568 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLOD3O60568 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLOD3O60568 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PLOD3O60568 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PLOD3O60568 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLOD3O60568 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLOD3O60568 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLOD3O60568 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLOD3O60568 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLOD3O60568 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLOD3O60568 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLOD3O60568 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLOD3O60568 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLOD3O60568 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PLOD3O60568 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLOD3O60568 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLOD3O60568 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLOD3O60568 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLOD3O60568 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLOD3O60568 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLOD3O60568 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLOD3O60568 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLOD3O60568 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLOD3O60568 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLOD3O60568 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLOD3O60568 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLOD3O60568 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLOD3O60568 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PLOD3O60568 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PLOD3O60568 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PLOD3O60568 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLOD3O60568 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLOD3O60568 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLOD3O60568 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLOD3O60568 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLOD3O60568 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLOD3O60568 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLOD3O60568 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLOD3O60568 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLOD3O60568 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PLOD3O60568 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PLOD3O60568 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLOD3O60568 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLOD3O60568 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLOD3O60568 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLOD3O60568 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PLOD3O60568 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLOD3O60568 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLOD3O60568 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLOD3O60568 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLOD3O60568 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLOD3O60568 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLOD3O60568 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLOD3O60568 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLOD3O60568 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLOD3O60568 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLOD3O60568 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLOD3O60568 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLOD3O60568 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLOD3O60568 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLOD3O60568 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLOD3O60568 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLOD3O60568 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PLOD3O60568 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLOD3O60568 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLOD3O60568 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLOD3O60568 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PLOD3O60568 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLOD3O60568 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLOD3O60568 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLOD3O60568 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLOD3O60568 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLOD3O60568 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLOD3O60568 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLOD3O60568 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLOD3O60568 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLOD3O60568 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLOD3O60568 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLOD3O60568 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLOD3O60568 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLOD3O60568 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLOD3O60568 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PLOD3O60568 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PLOD3O60568 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PLOD3O60568 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms