Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
STX6O43752 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
STX6O43752 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
STX6O43752 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
STX6O43752 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
STX6O43752 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
STX6O43752 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
STX6O43752 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
STX6O43752 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
STX6O43752 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
STX6O43752 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
STX6O43752 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
STX6O43752 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
STX6O43752 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
STX6O43752 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
STX6O43752 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
STX6O43752 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
STX6O43752 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
STX6O43752 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
STX6O43752 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
STX6O43752 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
STX6O43752 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
STX6O43752 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
STX6O43752 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
STX6O43752 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
STX6O43752 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
STX6O43752 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
STX6O43752 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
STX6O43752 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
STX6O43752 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
STX6O43752 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
STX6O43752 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
STX6O43752 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
STX6O43752 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
STX6O43752 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
STX6O43752 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
STX6O43752 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
STX6O43752 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
STX6O43752 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
STX6O43752 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
STX6O43752 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
STX6O43752 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
STX6O43752 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
STX6O43752 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
STX6O43752 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
STX6O43752 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
STX6O43752 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
STX6O43752 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
STX6O43752 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
STX6O43752 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
STX6O43752 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
STX6O43752 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
STX6O43752 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
STX6O43752 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
STX6O43752 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
STX6O43752 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
STX6O43752 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
STX6O43752 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
STX6O43752 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
STX6O43752 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
STX6O43752 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
STX6O43752 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
STX6O43752 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
STX6O43752 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
STX6O43752 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
STX6O43752 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
STX6O43752 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
STX6O43752 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
STX6O43752 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
STX6O43752 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
STX6O43752 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
STX6O43752 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
STX6O43752 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
STX6O43752 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
STX6O43752 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
STX6O43752 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
STX6O43752 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
STX6O43752 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
STX6O43752 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
STX6O43752 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
STX6O43752 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
STX6O43752 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
STX6O43752 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
STX6O43752 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
STX6O43752 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
STX6O43752 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
STX6O43752 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
STX6O43752 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
STX6O43752 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
STX6O43752 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
STX6O43752 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
STX6O43752 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
STX6O43752 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
STX6O43752 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
STX6O43752 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
STX6O43752 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
STX6O43752 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
STX6O43752 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
STX6O43752 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
STX6O43752 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms