Protein–RNA interactions for Protein: O43678

NDUFA2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA2O43678 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFA2O43678 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFA2O43678 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFA2O43678 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFA2O43678 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFA2O43678 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFA2O43678 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFA2O43678 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDUFA2O43678 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDUFA2O43678 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFA2O43678 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDUFA2O43678 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDUFA2O43678 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDUFA2O43678 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFA2O43678 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFA2O43678 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFA2O43678 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFA2O43678 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFA2O43678 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFA2O43678 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFA2O43678 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFA2O43678 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFA2O43678 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFA2O43678 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFA2O43678 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFA2O43678 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFA2O43678 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFA2O43678 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFA2O43678 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDUFA2O43678 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDUFA2O43678 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDUFA2O43678 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDUFA2O43678 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDUFA2O43678 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFA2O43678 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFA2O43678 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFA2O43678 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFA2O43678 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFA2O43678 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFA2O43678 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFA2O43678 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFA2O43678 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFA2O43678 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFA2O43678 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFA2O43678 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFA2O43678 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFA2O43678 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFA2O43678 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFA2O43678 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFA2O43678 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFA2O43678 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFA2O43678 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFA2O43678 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFA2O43678 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFA2O43678 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFA2O43678 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFA2O43678 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFA2O43678 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFA2O43678 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFA2O43678 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFA2O43678 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFA2O43678 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFA2O43678 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFA2O43678 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFA2O43678 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFA2O43678 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFA2O43678 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFA2O43678 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFA2O43678 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFA2O43678 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFA2O43678 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFA2O43678 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFA2O43678 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFA2O43678 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFA2O43678 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFA2O43678 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFA2O43678 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFA2O43678 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFA2O43678 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFA2O43678 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFA2O43678 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFA2O43678 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFA2O43678 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFA2O43678 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFA2O43678 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFA2O43678 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFA2O43678 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFA2O43678 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFA2O43678 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFA2O43678 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFA2O43678 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFA2O43678 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFA2O43678 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFA2O43678 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFA2O43678 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFA2O43678 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFA2O43678 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFA2O43678 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFA2O43678 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NDUFA2O43678 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms