Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
KCNQ2O43526 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
KCNQ2O43526 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
KCNQ2O43526 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
KCNQ2O43526 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
KCNQ2O43526 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC36.11■■■■□ 3.37
KCNQ2O43526 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
KCNQ2O43526 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
KCNQ2O43526 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
KCNQ2O43526 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
KCNQ2O43526 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
KCNQ2O43526 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
KCNQ2O43526 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
KCNQ2O43526 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
KCNQ2O43526 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
KCNQ2O43526 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC36.05■■■■□ 3.36
KCNQ2O43526 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
KCNQ2O43526 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
KCNQ2O43526 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
KCNQ2O43526 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
KCNQ2O43526 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
KCNQ2O43526 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
KCNQ2O43526 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
KCNQ2O43526 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
KCNQ2O43526 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
KCNQ2O43526 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
KCNQ2O43526 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
KCNQ2O43526 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
KCNQ2O43526 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
KCNQ2O43526 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
KCNQ2O43526 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
KCNQ2O43526 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
KCNQ2O43526 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
KCNQ2O43526 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
KCNQ2O43526 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
KCNQ2O43526 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
KCNQ2O43526 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
KCNQ2O43526 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
KCNQ2O43526 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
KCNQ2O43526 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
KCNQ2O43526 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
KCNQ2O43526 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
KCNQ2O43526 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
KCNQ2O43526 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
KCNQ2O43526 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
KCNQ2O43526 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
KCNQ2O43526 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
KCNQ2O43526 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
KCNQ2O43526 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
KCNQ2O43526 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
KCNQ2O43526 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
KCNQ2O43526 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC35.78■■■■□ 3.32
KCNQ2O43526 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
KCNQ2O43526 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
KCNQ2O43526 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC35.74■■■■□ 3.31
KCNQ2O43526 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
KCNQ2O43526 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.72■■■■□ 3.31
KCNQ2O43526 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
KCNQ2O43526 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
KCNQ2O43526 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
KCNQ2O43526 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
KCNQ2O43526 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
KCNQ2O43526 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
KCNQ2O43526 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
KCNQ2O43526 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
KCNQ2O43526 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
KCNQ2O43526 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
KCNQ2O43526 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
KCNQ2O43526 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
KCNQ2O43526 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC35.65■■■■□ 3.3
KCNQ2O43526 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
KCNQ2O43526 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
KCNQ2O43526 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
KCNQ2O43526 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
KCNQ2O43526 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
KCNQ2O43526 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
KCNQ2O43526 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
KCNQ2O43526 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
KCNQ2O43526 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
KCNQ2O43526 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
KCNQ2O43526 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
KCNQ2O43526 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
KCNQ2O43526 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
KCNQ2O43526 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
KCNQ2O43526 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
KCNQ2O43526 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
KCNQ2O43526 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
KCNQ2O43526 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
KCNQ2O43526 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
KCNQ2O43526 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
KCNQ2O43526 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
KCNQ2O43526 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
KCNQ2O43526 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
KCNQ2O43526 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC35.46■■■■□ 3.27
KCNQ2O43526 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
KCNQ2O43526 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
KCNQ2O43526 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
KCNQ2O43526 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
KCNQ2O43526 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
KCNQ2O43526 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms