Protein–RNA interactions for Protein: O43508

TNFSF12, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 12, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12O43508 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF12O43508 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF12O43508 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF12O43508 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF12O43508 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF12O43508 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF12O43508 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF12O43508 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF12O43508 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF12O43508 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF12O43508 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF12O43508 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF12O43508 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF12O43508 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF12O43508 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNFSF12O43508 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFSF12O43508 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFSF12O43508 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFSF12O43508 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF12O43508 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF12O43508 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF12O43508 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF12O43508 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF12O43508 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF12O43508 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF12O43508 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF12O43508 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF12O43508 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF12O43508 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFSF12O43508 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFSF12O43508 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFSF12O43508 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFSF12O43508 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNFSF12O43508 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNFSF12O43508 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF12O43508 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF12O43508 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF12O43508 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF12O43508 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF12O43508 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF12O43508 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF12O43508 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF12O43508 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF12O43508 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF12O43508 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF12O43508 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF12O43508 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF12O43508 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF12O43508 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF12O43508 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF12O43508 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF12O43508 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF12O43508 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF12O43508 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF12O43508 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF12O43508 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF12O43508 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF12O43508 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF12O43508 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF12O43508 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF12O43508 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF12O43508 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF12O43508 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF12O43508 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF12O43508 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF12O43508 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF12O43508 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF12O43508 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF12O43508 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF12O43508 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF12O43508 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF12O43508 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNFSF12O43508 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNFSF12O43508 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFSF12O43508 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFSF12O43508 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF12O43508 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF12O43508 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF12O43508 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF12O43508 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFSF12O43508 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFSF12O43508 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFSF12O43508 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFSF12O43508 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFSF12O43508 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFSF12O43508 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFSF12O43508 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFSF12O43508 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF12O43508 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF12O43508 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF12O43508 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF12O43508 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF12O43508 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF12O43508 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF12O43508 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF12O43508 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF12O43508 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF12O43508 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF12O43508 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF12O43508 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms