Protein–RNA interactions for Protein: O43182

ARHGAP6, Rho GTPase-activating protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP6O43182 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ARHGAP6O43182 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ARHGAP6O43182 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ARHGAP6O43182 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARHGAP6O43182 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARHGAP6O43182 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ARHGAP6O43182 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARHGAP6O43182 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARHGAP6O43182 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARHGAP6O43182 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARHGAP6O43182 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARHGAP6O43182 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARHGAP6O43182 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARHGAP6O43182 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARHGAP6O43182 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARHGAP6O43182 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARHGAP6O43182 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARHGAP6O43182 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARHGAP6O43182 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARHGAP6O43182 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARHGAP6O43182 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARHGAP6O43182 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARHGAP6O43182 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARHGAP6O43182 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARHGAP6O43182 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARHGAP6O43182 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARHGAP6O43182 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARHGAP6O43182 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARHGAP6O43182 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ARHGAP6O43182 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARHGAP6O43182 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARHGAP6O43182 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARHGAP6O43182 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARHGAP6O43182 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARHGAP6O43182 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARHGAP6O43182 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARHGAP6O43182 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARHGAP6O43182 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARHGAP6O43182 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ARHGAP6O43182 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ARHGAP6O43182 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARHGAP6O43182 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARHGAP6O43182 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ARHGAP6O43182 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ARHGAP6O43182 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ARHGAP6O43182 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ARHGAP6O43182 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ARHGAP6O43182 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARHGAP6O43182 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ARHGAP6O43182 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARHGAP6O43182 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARHGAP6O43182 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARHGAP6O43182 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARHGAP6O43182 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ARHGAP6O43182 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARHGAP6O43182 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARHGAP6O43182 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARHGAP6O43182 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ARHGAP6O43182 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARHGAP6O43182 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARHGAP6O43182 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARHGAP6O43182 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARHGAP6O43182 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARHGAP6O43182 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARHGAP6O43182 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARHGAP6O43182 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARHGAP6O43182 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARHGAP6O43182 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARHGAP6O43182 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARHGAP6O43182 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARHGAP6O43182 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARHGAP6O43182 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARHGAP6O43182 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARHGAP6O43182 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARHGAP6O43182 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARHGAP6O43182 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARHGAP6O43182 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARHGAP6O43182 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARHGAP6O43182 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARHGAP6O43182 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARHGAP6O43182 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARHGAP6O43182 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARHGAP6O43182 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARHGAP6O43182 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARHGAP6O43182 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARHGAP6O43182 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARHGAP6O43182 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ARHGAP6O43182 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARHGAP6O43182 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARHGAP6O43182 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARHGAP6O43182 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ARHGAP6O43182 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ARHGAP6O43182 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARHGAP6O43182 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARHGAP6O43182 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARHGAP6O43182 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARHGAP6O43182 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARHGAP6O43182 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARHGAP6O43182 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGAP6O43182 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.7 ms