Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
LAMA5O15230 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMA5O15230 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMA5O15230 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMA5O15230 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMA5O15230 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMA5O15230 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMA5O15230 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LAMA5O15230 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMA5O15230 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMA5O15230 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMA5O15230 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMA5O15230 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LAMA5O15230 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
LAMA5O15230 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LAMA5O15230 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LAMA5O15230 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMA5O15230 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMA5O15230 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMA5O15230 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMA5O15230 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMA5O15230 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMA5O15230 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMA5O15230 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMA5O15230 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMA5O15230 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMA5O15230 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMA5O15230 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMA5O15230 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMA5O15230 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMA5O15230 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMA5O15230 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LAMA5O15230 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMA5O15230 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMA5O15230 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMA5O15230 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMA5O15230 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMA5O15230 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMA5O15230 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMA5O15230 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMA5O15230 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMA5O15230 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMA5O15230 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMA5O15230 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMA5O15230 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAMA5O15230 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMA5O15230 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMA5O15230 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMA5O15230 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMA5O15230 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMA5O15230 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMA5O15230 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMA5O15230 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMA5O15230 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMA5O15230 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMA5O15230 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMA5O15230 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMA5O15230 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMA5O15230 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMA5O15230 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMA5O15230 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMA5O15230 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMA5O15230 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMA5O15230 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMA5O15230 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMA5O15230 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMA5O15230 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMA5O15230 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMA5O15230 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMA5O15230 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMA5O15230 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMA5O15230 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMA5O15230 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMA5O15230 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMA5O15230 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMA5O15230 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMA5O15230 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMA5O15230 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMA5O15230 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMA5O15230 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LAMA5O15230 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LAMA5O15230 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMA5O15230 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAMA5O15230 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAMA5O15230 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMA5O15230 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMA5O15230 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMA5O15230 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMA5O15230 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMA5O15230 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMA5O15230 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMA5O15230 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMA5O15230 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMA5O15230 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMA5O15230 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMA5O15230 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMA5O15230 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMA5O15230 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMA5O15230 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMA5O15230 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms