Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CEP290O15078 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CEP290O15078 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CEP290O15078 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CEP290O15078 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CEP290O15078 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CEP290O15078 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CEP290O15078 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CEP290O15078 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CEP290O15078 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CEP290O15078 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CEP290O15078 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
CEP290O15078 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CEP290O15078 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CEP290O15078 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CEP290O15078 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CEP290O15078 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CEP290O15078 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CEP290O15078 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CEP290O15078 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CEP290O15078 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
CEP290O15078 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CEP290O15078 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
CEP290O15078 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CEP290O15078 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CEP290O15078 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CEP290O15078 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CEP290O15078 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CEP290O15078 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
CEP290O15078 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CEP290O15078 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CEP290O15078 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CEP290O15078 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CEP290O15078 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CEP290O15078 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CEP290O15078 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CEP290O15078 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CEP290O15078 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CEP290O15078 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CEP290O15078 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CEP290O15078 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
CEP290O15078 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CEP290O15078 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CEP290O15078 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CEP290O15078 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CEP290O15078 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CEP290O15078 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CEP290O15078 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CEP290O15078 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CEP290O15078 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CEP290O15078 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CEP290O15078 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CEP290O15078 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CEP290O15078 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CEP290O15078 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CEP290O15078 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CEP290O15078 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CEP290O15078 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CEP290O15078 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CEP290O15078 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CEP290O15078 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
CEP290O15078 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CEP290O15078 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CEP290O15078 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CEP290O15078 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CEP290O15078 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CEP290O15078 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CEP290O15078 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CEP290O15078 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CEP290O15078 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CEP290O15078 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CEP290O15078 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CEP290O15078 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
CEP290O15078 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CEP290O15078 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CEP290O15078 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CEP290O15078 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CEP290O15078 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CEP290O15078 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CEP290O15078 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CEP290O15078 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CEP290O15078 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CEP290O15078 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
CEP290O15078 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
CEP290O15078 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
CEP290O15078 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
CEP290O15078 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CEP290O15078 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CEP290O15078 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CEP290O15078 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CEP290O15078 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CEP290O15078 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CEP290O15078 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CEP290O15078 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CEP290O15078 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CEP290O15078 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CEP290O15078 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CEP290O15078 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CEP290O15078 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CEP290O15078 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
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