Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
SETD1AO15047 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.85
SETD1AO15047 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
SETD1AO15047 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
SETD1AO15047 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
SETD1AO15047 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
SETD1AO15047 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
SETD1AO15047 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
SETD1AO15047 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
SETD1AO15047 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC39.02■■■■□ 3.84
SETD1AO15047 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
SETD1AO15047 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
SETD1AO15047 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
SETD1AO15047 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
SETD1AO15047 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
SETD1AO15047 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
SETD1AO15047 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC38.97■■■■□ 3.83
SETD1AO15047 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC38.97■■■■□ 3.83
SETD1AO15047 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC38.97■■■■□ 3.83
SETD1AO15047 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC38.96■■■■□ 3.83
SETD1AO15047 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
SETD1AO15047 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.94■■■■□ 3.82
SETD1AO15047 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
SETD1AO15047 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
SETD1AO15047 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
SETD1AO15047 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
SETD1AO15047 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
SETD1AO15047 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
SETD1AO15047 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC38.87■■■■□ 3.81
SETD1AO15047 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
SETD1AO15047 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC38.86■■■■□ 3.81
SETD1AO15047 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
SETD1AO15047 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
SETD1AO15047 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
SETD1AO15047 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
SETD1AO15047 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
SETD1AO15047 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC38.83■■■■□ 3.81
SETD1AO15047 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
SETD1AO15047 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
SETD1AO15047 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
SETD1AO15047 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
SETD1AO15047 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
SETD1AO15047 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC38.78■■■■□ 3.8
SETD1AO15047 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
SETD1AO15047 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
SETD1AO15047 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
SETD1AO15047 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
SETD1AO15047 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
SETD1AO15047 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
SETD1AO15047 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
SETD1AO15047 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
SETD1AO15047 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
SETD1AO15047 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
SETD1AO15047 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
SETD1AO15047 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
SETD1AO15047 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
SETD1AO15047 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
SETD1AO15047 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
SETD1AO15047 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
SETD1AO15047 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC38.64■■■■□ 3.78
SETD1AO15047 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
SETD1AO15047 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
SETD1AO15047 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
SETD1AO15047 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
SETD1AO15047 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
SETD1AO15047 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
SETD1AO15047 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
SETD1AO15047 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
SETD1AO15047 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
SETD1AO15047 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC38.56■■■■□ 3.76
SETD1AO15047 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
SETD1AO15047 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
SETD1AO15047 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
SETD1AO15047 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
SETD1AO15047 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
SETD1AO15047 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
SETD1AO15047 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
SETD1AO15047 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
SETD1AO15047 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
SETD1AO15047 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
SETD1AO15047 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
SETD1AO15047 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
SETD1AO15047 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
SETD1AO15047 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
SETD1AO15047 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
SETD1AO15047 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
SETD1AO15047 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
SETD1AO15047 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
SETD1AO15047 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
SETD1AO15047 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
SETD1AO15047 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
SETD1AO15047 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
SETD1AO15047 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
SETD1AO15047 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
SETD1AO15047 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
SETD1AO15047 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
SETD1AO15047 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
SETD1AO15047 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
SETD1AO15047 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
SETD1AO15047 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms