Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP9YO00507 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP9YO00507 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP9YO00507 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP9YO00507 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP9YO00507 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP9YO00507 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP9YO00507 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP9YO00507 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP9YO00507 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP9YO00507 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP9YO00507 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USP9YO00507 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP9YO00507 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP9YO00507 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP9YO00507 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP9YO00507 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
USP9YO00507 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP9YO00507 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP9YO00507 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP9YO00507 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP9YO00507 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP9YO00507 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP9YO00507 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP9YO00507 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
USP9YO00507 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP9YO00507 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP9YO00507 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP9YO00507 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
USP9YO00507 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP9YO00507 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP9YO00507 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP9YO00507 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP9YO00507 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP9YO00507 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP9YO00507 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP9YO00507 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP9YO00507 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
USP9YO00507 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP9YO00507 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP9YO00507 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP9YO00507 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP9YO00507 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP9YO00507 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP9YO00507 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP9YO00507 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP9YO00507 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP9YO00507 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP9YO00507 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP9YO00507 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP9YO00507 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP9YO00507 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP9YO00507 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP9YO00507 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP9YO00507 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP9YO00507 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP9YO00507 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP9YO00507 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP9YO00507 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
USP9YO00507 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP9YO00507 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP9YO00507 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP9YO00507 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP9YO00507 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP9YO00507 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP9YO00507 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP9YO00507 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP9YO00507 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP9YO00507 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP9YO00507 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP9YO00507 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP9YO00507 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP9YO00507 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP9YO00507 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP9YO00507 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP9YO00507 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
USP9YO00507 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP9YO00507 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP9YO00507 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP9YO00507 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP9YO00507 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
USP9YO00507 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP9YO00507 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP9YO00507 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
USP9YO00507 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
USP9YO00507 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
USP9YO00507 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP9YO00507 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP9YO00507 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP9YO00507 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP9YO00507 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP9YO00507 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP9YO00507 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP9YO00507 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP9YO00507 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP9YO00507 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP9YO00507 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP9YO00507 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP9YO00507 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP9YO00507 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms