Protein–RNA interactions for Protein: O00499

BIN1, Myc box-dependent-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN1O00499 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
BIN1O00499 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
BIN1O00499 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
BIN1O00499 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
BIN1O00499 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
BIN1O00499 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
BIN1O00499 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
BIN1O00499 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
BIN1O00499 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
BIN1O00499 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
BIN1O00499 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
BIN1O00499 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
BIN1O00499 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
BIN1O00499 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
BIN1O00499 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
BIN1O00499 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
BIN1O00499 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
BIN1O00499 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
BIN1O00499 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
BIN1O00499 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
BIN1O00499 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
BIN1O00499 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
BIN1O00499 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
BIN1O00499 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
BIN1O00499 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
BIN1O00499 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
BIN1O00499 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
BIN1O00499 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
BIN1O00499 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
BIN1O00499 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
BIN1O00499 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
BIN1O00499 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
BIN1O00499 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
BIN1O00499 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
BIN1O00499 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
BIN1O00499 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
BIN1O00499 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
BIN1O00499 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
BIN1O00499 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
BIN1O00499 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
BIN1O00499 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
BIN1O00499 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
BIN1O00499 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
BIN1O00499 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
BIN1O00499 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
BIN1O00499 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
BIN1O00499 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
BIN1O00499 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
BIN1O00499 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
BIN1O00499 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
BIN1O00499 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
BIN1O00499 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
BIN1O00499 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
BIN1O00499 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
BIN1O00499 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
BIN1O00499 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
BIN1O00499 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
BIN1O00499 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
BIN1O00499 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
BIN1O00499 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
BIN1O00499 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
BIN1O00499 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
BIN1O00499 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
BIN1O00499 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
BIN1O00499 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
BIN1O00499 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
BIN1O00499 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
BIN1O00499 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
BIN1O00499 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
BIN1O00499 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
BIN1O00499 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
BIN1O00499 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
BIN1O00499 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
BIN1O00499 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
BIN1O00499 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
BIN1O00499 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
BIN1O00499 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
BIN1O00499 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
BIN1O00499 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
BIN1O00499 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
BIN1O00499 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
BIN1O00499 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
BIN1O00499 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
BIN1O00499 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
BIN1O00499 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
BIN1O00499 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BIN1O00499 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
BIN1O00499 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
BIN1O00499 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
BIN1O00499 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
BIN1O00499 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
BIN1O00499 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
BIN1O00499 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BIN1O00499 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
BIN1O00499 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
BIN1O00499 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BIN1O00499 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BIN1O00499 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
BIN1O00499 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
BIN1O00499 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms