Protein–RNA interactions for Protein: O00499

BIN1, Myc box-dependent-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN1O00499 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
BIN1O00499 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
BIN1O00499 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
BIN1O00499 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
BIN1O00499 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
BIN1O00499 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
BIN1O00499 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
BIN1O00499 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
BIN1O00499 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
BIN1O00499 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
BIN1O00499 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
BIN1O00499 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
BIN1O00499 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
BIN1O00499 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
BIN1O00499 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
BIN1O00499 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
BIN1O00499 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
BIN1O00499 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
BIN1O00499 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
BIN1O00499 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
BIN1O00499 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
BIN1O00499 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
BIN1O00499 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
BIN1O00499 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
BIN1O00499 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
BIN1O00499 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
BIN1O00499 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
BIN1O00499 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
BIN1O00499 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
BIN1O00499 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
BIN1O00499 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
BIN1O00499 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
BIN1O00499 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
BIN1O00499 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
BIN1O00499 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
BIN1O00499 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
BIN1O00499 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
BIN1O00499 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
BIN1O00499 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
BIN1O00499 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
BIN1O00499 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
BIN1O00499 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
BIN1O00499 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
BIN1O00499 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
BIN1O00499 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
BIN1O00499 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
BIN1O00499 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
BIN1O00499 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
BIN1O00499 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
BIN1O00499 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
BIN1O00499 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
BIN1O00499 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
BIN1O00499 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
BIN1O00499 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
BIN1O00499 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
BIN1O00499 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
BIN1O00499 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
BIN1O00499 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
BIN1O00499 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
BIN1O00499 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
BIN1O00499 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
BIN1O00499 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
BIN1O00499 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
BIN1O00499 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
BIN1O00499 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
BIN1O00499 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
BIN1O00499 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
BIN1O00499 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
BIN1O00499 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
BIN1O00499 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
BIN1O00499 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
BIN1O00499 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
BIN1O00499 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
BIN1O00499 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
BIN1O00499 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
BIN1O00499 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
BIN1O00499 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
BIN1O00499 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
BIN1O00499 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
BIN1O00499 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
BIN1O00499 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
BIN1O00499 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
BIN1O00499 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
BIN1O00499 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
BIN1O00499 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
BIN1O00499 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BIN1O00499 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
BIN1O00499 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
BIN1O00499 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
BIN1O00499 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
BIN1O00499 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
BIN1O00499 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
BIN1O00499 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BIN1O00499 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
BIN1O00499 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
BIN1O00499 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BIN1O00499 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BIN1O00499 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
BIN1O00499 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
BIN1O00499 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms