Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
HIP1O00291 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
HIP1O00291 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
HIP1O00291 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
HIP1O00291 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
HIP1O00291 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
HIP1O00291 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
HIP1O00291 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
HIP1O00291 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
HIP1O00291 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
HIP1O00291 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
HIP1O00291 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
HIP1O00291 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
HIP1O00291 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
HIP1O00291 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
HIP1O00291 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
HIP1O00291 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
HIP1O00291 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
HIP1O00291 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
HIP1O00291 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
HIP1O00291 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
HIP1O00291 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
HIP1O00291 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
HIP1O00291 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
HIP1O00291 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
HIP1O00291 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
HIP1O00291 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
HIP1O00291 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
HIP1O00291 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
HIP1O00291 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
HIP1O00291 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
HIP1O00291 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
HIP1O00291 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
HIP1O00291 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
HIP1O00291 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
HIP1O00291 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
HIP1O00291 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
HIP1O00291 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
HIP1O00291 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
HIP1O00291 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
HIP1O00291 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
HIP1O00291 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
HIP1O00291 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
HIP1O00291 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
HIP1O00291 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
HIP1O00291 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
HIP1O00291 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
HIP1O00291 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
HIP1O00291 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
HIP1O00291 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
HIP1O00291 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
HIP1O00291 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
HIP1O00291 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
HIP1O00291 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
HIP1O00291 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
HIP1O00291 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
HIP1O00291 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
HIP1O00291 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
HIP1O00291 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
HIP1O00291 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
HIP1O00291 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
HIP1O00291 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
HIP1O00291 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
HIP1O00291 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
HIP1O00291 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
HIP1O00291 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
HIP1O00291 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
HIP1O00291 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
HIP1O00291 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
HIP1O00291 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
HIP1O00291 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
HIP1O00291 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
HIP1O00291 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
HIP1O00291 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
HIP1O00291 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
HIP1O00291 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
HIP1O00291 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
HIP1O00291 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
HIP1O00291 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
HIP1O00291 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
HIP1O00291 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
HIP1O00291 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
HIP1O00291 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
HIP1O00291 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
HIP1O00291 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
HIP1O00291 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
HIP1O00291 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
HIP1O00291 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
HIP1O00291 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
HIP1O00291 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
HIP1O00291 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
HIP1O00291 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
HIP1O00291 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
HIP1O00291 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
HIP1O00291 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
HIP1O00291 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
HIP1O00291 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
HIP1O00291 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
HIP1O00291 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
HIP1O00291 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms