Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
J3QRK9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
J3QRK9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
J3QRK9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
J3QRK9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
J3QRK9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
J3QRK9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
J3QRK9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
J3QRK9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
J3QRK9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
J3QRK9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
J3QRK9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
J3QRK9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
J3QRK9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
J3QRK9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
J3QRK9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
J3QRK9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
J3QRK9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
J3QRK9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
J3QRK9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
J3QRK9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
J3QRK9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
J3QRK9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
J3QRK9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
J3QRK9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
J3QRK9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
J3QRK9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
J3QRK9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
J3QRK9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
J3QRK9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
J3QRK9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
J3QRK9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
J3QRK9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
J3QRK9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
J3QRK9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
J3QRK9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
J3QRK9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
J3QRK9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
J3QRK9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
J3QRK9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
J3QRK9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
J3QRK9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
J3QRK9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
J3QRK9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
J3QRK9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
J3QRK9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
J3QRK9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
J3QRK9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
J3QRK9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
J3QRK9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
J3QRK9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
J3QRK9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
J3QRK9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
J3QRK9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
J3QRK9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
J3QRK9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
J3QRK9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
J3QRK9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
J3QRK9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
J3QRK9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
J3QRK9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
J3QRK9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
J3QRK9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
J3QRK9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
J3QRK9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
J3QRK9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
J3QRK9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
J3QRK9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
J3QRK9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
J3QRK9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
J3QRK9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
J3QRK9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
J3QRK9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
J3QRK9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
J3QRK9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
J3QRK9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
J3QRK9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
J3QRK9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
J3QRK9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
J3QRK9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
J3QRK9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
J3QRK9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
J3QRK9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
J3QRK9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
J3QRK9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
J3QRK9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
J3QRK9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
J3QRK9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
J3QRK9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
J3QRK9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
J3QRK9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
J3QRK9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
J3QRK9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
J3QRK9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
J3QRK9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
J3QRK9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
J3QRK9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
J3QRK9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
J3QRK9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
J3QRK9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms