Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC41.45■■■■■ 4.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC41.43■■■■■ 4.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC41.43■■■■■ 4.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC41.38■■■■■ 4.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC41.35■■■■■ 4.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC41.3■■■■■ 4.2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC41.27■■■■■ 4.2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC41.26■■■■■ 4.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC41.15■■■■■ 4.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC41.13■■■■■ 4.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC41.13■■■■■ 4.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC41.09■■■■■ 4.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC41.01■■■■■ 4.15
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.15
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC40.98■■■■■ 4.15
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC40.92■■■■■ 4.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC40.88■■■■■ 4.13
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC40.84■■■■■ 4.13
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC40.79■■■■■ 4.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC40.75■■■■■ 4.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC40.75■■■■■ 4.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC40.72■■■■■ 4.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.6 ms