Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRDCB7Z8K6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRDCB7Z8K6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRDCB7Z8K6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRDCB7Z8K6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRDCB7Z8K6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRDCB7Z8K6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRDCB7Z8K6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRDCB7Z8K6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRDCB7Z8K6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRDCB7Z8K6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRDCB7Z8K6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRDCB7Z8K6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRDCB7Z8K6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRDCB7Z8K6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRDCB7Z8K6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRDCB7Z8K6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRDCB7Z8K6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRDCB7Z8K6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRDCB7Z8K6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRDCB7Z8K6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRDCB7Z8K6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRDCB7Z8K6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRDCB7Z8K6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRDCB7Z8K6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRDCB7Z8K6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRDCB7Z8K6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRDCB7Z8K6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRDCB7Z8K6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRDCB7Z8K6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRDCB7Z8K6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRDCB7Z8K6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRDCB7Z8K6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRDCB7Z8K6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRDCB7Z8K6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRDCB7Z8K6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRDCB7Z8K6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRDCB7Z8K6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRDCB7Z8K6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRDCB7Z8K6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRDCB7Z8K6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRDCB7Z8K6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRDCB7Z8K6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRDCB7Z8K6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRDCB7Z8K6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRDCB7Z8K6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRDCB7Z8K6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRDCB7Z8K6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRDCB7Z8K6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRDCB7Z8K6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRDCB7Z8K6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRDCB7Z8K6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRDCB7Z8K6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRDCB7Z8K6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRDCB7Z8K6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRDCB7Z8K6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRDCB7Z8K6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRDCB7Z8K6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRDCB7Z8K6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRDCB7Z8K6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRDCB7Z8K6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRDCB7Z8K6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRDCB7Z8K6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRDCB7Z8K6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRDCB7Z8K6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRDCB7Z8K6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRDCB7Z8K6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRDCB7Z8K6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRDCB7Z8K6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRDCB7Z8K6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRDCB7Z8K6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRDCB7Z8K6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRDCB7Z8K6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRDCB7Z8K6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRDCB7Z8K6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRDCB7Z8K6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRDCB7Z8K6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRDCB7Z8K6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRDCB7Z8K6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRDCB7Z8K6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRDCB7Z8K6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRDCB7Z8K6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRDCB7Z8K6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRDCB7Z8K6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRDCB7Z8K6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRDCB7Z8K6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRDCB7Z8K6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRDCB7Z8K6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRDCB7Z8K6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRDCB7Z8K6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRDCB7Z8K6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRDCB7Z8K6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRDCB7Z8K6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRDCB7Z8K6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRDCB7Z8K6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRDCB7Z8K6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRDCB7Z8K6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRDCB7Z8K6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRDCB7Z8K6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRDCB7Z8K6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms