Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C4orf47A7E2U8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C4orf47A7E2U8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C4orf47A7E2U8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
C4orf47A7E2U8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
C4orf47A7E2U8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C4orf47A7E2U8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
C4orf47A7E2U8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C4orf47A7E2U8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C4orf47A7E2U8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
C4orf47A7E2U8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
C4orf47A7E2U8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
C4orf47A7E2U8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C4orf47A7E2U8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C4orf47A7E2U8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
C4orf47A7E2U8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
C4orf47A7E2U8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
C4orf47A7E2U8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
C4orf47A7E2U8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
C4orf47A7E2U8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
C4orf47A7E2U8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C4orf47A7E2U8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C4orf47A7E2U8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C4orf47A7E2U8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
C4orf47A7E2U8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
C4orf47A7E2U8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
C4orf47A7E2U8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
C4orf47A7E2U8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
C4orf47A7E2U8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
C4orf47A7E2U8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
C4orf47A7E2U8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
C4orf47A7E2U8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
C4orf47A7E2U8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C4orf47A7E2U8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
C4orf47A7E2U8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
C4orf47A7E2U8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
C4orf47A7E2U8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
C4orf47A7E2U8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
C4orf47A7E2U8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
C4orf47A7E2U8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C4orf47A7E2U8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
C4orf47A7E2U8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
C4orf47A7E2U8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
C4orf47A7E2U8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
C4orf47A7E2U8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C4orf47A7E2U8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
C4orf47A7E2U8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C4orf47A7E2U8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C4orf47A7E2U8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
C4orf47A7E2U8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C4orf47A7E2U8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C4orf47A7E2U8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C4orf47A7E2U8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
C4orf47A7E2U8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C4orf47A7E2U8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C4orf47A7E2U8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C4orf47A7E2U8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C4orf47A7E2U8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
C4orf47A7E2U8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
C4orf47A7E2U8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C4orf47A7E2U8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C4orf47A7E2U8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C4orf47A7E2U8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C4orf47A7E2U8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C4orf47A7E2U8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C4orf47A7E2U8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C4orf47A7E2U8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C4orf47A7E2U8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C4orf47A7E2U8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C4orf47A7E2U8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C4orf47A7E2U8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C4orf47A7E2U8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C4orf47A7E2U8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C4orf47A7E2U8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C4orf47A7E2U8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C4orf47A7E2U8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
C4orf47A7E2U8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C4orf47A7E2U8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
C4orf47A7E2U8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
C4orf47A7E2U8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
C4orf47A7E2U8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
C4orf47A7E2U8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
C4orf47A7E2U8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
C4orf47A7E2U8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
C4orf47A7E2U8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
C4orf47A7E2U8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
C4orf47A7E2U8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
C4orf47A7E2U8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
C4orf47A7E2U8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
C4orf47A7E2U8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
C4orf47A7E2U8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C4orf47A7E2U8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
C4orf47A7E2U8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
C4orf47A7E2U8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
C4orf47A7E2U8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
C4orf47A7E2U8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C4orf47A7E2U8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
C4orf47A7E2U8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C4orf47A7E2U8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
C4orf47A7E2U8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms