Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCNX2A6NKB5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCNX2A6NKB5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCNX2A6NKB5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCNX2A6NKB5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCNX2A6NKB5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCNX2A6NKB5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCNX2A6NKB5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCNX2A6NKB5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCNX2A6NKB5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCNX2A6NKB5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCNX2A6NKB5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCNX2A6NKB5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCNX2A6NKB5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCNX2A6NKB5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCNX2A6NKB5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCNX2A6NKB5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCNX2A6NKB5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCNX2A6NKB5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCNX2A6NKB5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PCNX2A6NKB5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCNX2A6NKB5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCNX2A6NKB5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCNX2A6NKB5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCNX2A6NKB5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCNX2A6NKB5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCNX2A6NKB5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCNX2A6NKB5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCNX2A6NKB5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCNX2A6NKB5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCNX2A6NKB5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCNX2A6NKB5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PCNX2A6NKB5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCNX2A6NKB5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCNX2A6NKB5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PCNX2A6NKB5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PCNX2A6NKB5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCNX2A6NKB5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCNX2A6NKB5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCNX2A6NKB5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCNX2A6NKB5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCNX2A6NKB5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCNX2A6NKB5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCNX2A6NKB5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PCNX2A6NKB5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCNX2A6NKB5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCNX2A6NKB5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCNX2A6NKB5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCNX2A6NKB5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PCNX2A6NKB5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCNX2A6NKB5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCNX2A6NKB5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PCNX2A6NKB5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCNX2A6NKB5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCNX2A6NKB5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PCNX2A6NKB5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCNX2A6NKB5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCNX2A6NKB5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCNX2A6NKB5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCNX2A6NKB5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCNX2A6NKB5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PCNX2A6NKB5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCNX2A6NKB5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCNX2A6NKB5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCNX2A6NKB5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCNX2A6NKB5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCNX2A6NKB5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCNX2A6NKB5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCNX2A6NKB5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCNX2A6NKB5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCNX2A6NKB5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCNX2A6NKB5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PCNX2A6NKB5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCNX2A6NKB5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCNX2A6NKB5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PCNX2A6NKB5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PCNX2A6NKB5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PCNX2A6NKB5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCNX2A6NKB5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCNX2A6NKB5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCNX2A6NKB5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCNX2A6NKB5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCNX2A6NKB5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCNX2A6NKB5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PCNX2A6NKB5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCNX2A6NKB5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCNX2A6NKB5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCNX2A6NKB5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCNX2A6NKB5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCNX2A6NKB5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCNX2A6NKB5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCNX2A6NKB5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCNX2A6NKB5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCNX2A6NKB5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCNX2A6NKB5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCNX2A6NKB5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCNX2A6NKB5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCNX2A6NKB5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCNX2A6NKB5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCNX2A6NKB5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 219.2 ms