Protein–RNA interactions for Protein: A6NHQ4

EPOP, Elongin BC and Polycomb repressive complex 2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPOPA6NHQ4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
EPOPA6NHQ4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
EPOPA6NHQ4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EPOPA6NHQ4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EPOPA6NHQ4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EPOPA6NHQ4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EPOPA6NHQ4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EPOPA6NHQ4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
EPOPA6NHQ4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EPOPA6NHQ4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
EPOPA6NHQ4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
EPOPA6NHQ4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
EPOPA6NHQ4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
EPOPA6NHQ4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
EPOPA6NHQ4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
EPOPA6NHQ4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
EPOPA6NHQ4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
EPOPA6NHQ4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
EPOPA6NHQ4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
EPOPA6NHQ4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
EPOPA6NHQ4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
EPOPA6NHQ4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
EPOPA6NHQ4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
EPOPA6NHQ4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
EPOPA6NHQ4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EPOPA6NHQ4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
EPOPA6NHQ4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
EPOPA6NHQ4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EPOPA6NHQ4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
EPOPA6NHQ4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EPOPA6NHQ4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EPOPA6NHQ4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EPOPA6NHQ4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EPOPA6NHQ4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
EPOPA6NHQ4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
EPOPA6NHQ4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
EPOPA6NHQ4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EPOPA6NHQ4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EPOPA6NHQ4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EPOPA6NHQ4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EPOPA6NHQ4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EPOPA6NHQ4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EPOPA6NHQ4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
EPOPA6NHQ4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
EPOPA6NHQ4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
EPOPA6NHQ4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
EPOPA6NHQ4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
EPOPA6NHQ4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
EPOPA6NHQ4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
EPOPA6NHQ4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
EPOPA6NHQ4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EPOPA6NHQ4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EPOPA6NHQ4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
EPOPA6NHQ4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EPOPA6NHQ4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EPOPA6NHQ4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
EPOPA6NHQ4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
EPOPA6NHQ4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EPOPA6NHQ4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EPOPA6NHQ4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EPOPA6NHQ4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EPOPA6NHQ4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EPOPA6NHQ4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EPOPA6NHQ4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EPOPA6NHQ4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EPOPA6NHQ4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EPOPA6NHQ4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EPOPA6NHQ4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
EPOPA6NHQ4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EPOPA6NHQ4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EPOPA6NHQ4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EPOPA6NHQ4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
EPOPA6NHQ4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
EPOPA6NHQ4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
EPOPA6NHQ4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
EPOPA6NHQ4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
EPOPA6NHQ4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EPOPA6NHQ4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EPOPA6NHQ4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
EPOPA6NHQ4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
EPOPA6NHQ4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
EPOPA6NHQ4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EPOPA6NHQ4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EPOPA6NHQ4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
EPOPA6NHQ4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
EPOPA6NHQ4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
EPOPA6NHQ4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
EPOPA6NHQ4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EPOPA6NHQ4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EPOPA6NHQ4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EPOPA6NHQ4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EPOPA6NHQ4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EPOPA6NHQ4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
EPOPA6NHQ4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
EPOPA6NHQ4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EPOPA6NHQ4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EPOPA6NHQ4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EPOPA6NHQ4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
EPOPA6NHQ4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EPOPA6NHQ4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms