Protein–RNA interactions for Protein: A6NH11

GLTPD2, Glycolipid transfer protein domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLTPD2A6NH11 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.78■■■■□ 3
GLTPD2A6NH11 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.78■■■■□ 3
GLTPD2A6NH11 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
GLTPD2A6NH11 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.78■■■■□ 3
GLTPD2A6NH11 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
GLTPD2A6NH11 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
GLTPD2A6NH11 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
GLTPD2A6NH11 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
GLTPD2A6NH11 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.72■■■□□ 2.99
GLTPD2A6NH11 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
GLTPD2A6NH11 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
GLTPD2A6NH11 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
GLTPD2A6NH11 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
GLTPD2A6NH11 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
GLTPD2A6NH11 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
GLTPD2A6NH11 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
GLTPD2A6NH11 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
GLTPD2A6NH11 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
GLTPD2A6NH11 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
GLTPD2A6NH11 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
GLTPD2A6NH11 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
GLTPD2A6NH11 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
GLTPD2A6NH11 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
GLTPD2A6NH11 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
GLTPD2A6NH11 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
GLTPD2A6NH11 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
GLTPD2A6NH11 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
GLTPD2A6NH11 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
GLTPD2A6NH11 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
GLTPD2A6NH11 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.54■■■□□ 2.96
GLTPD2A6NH11 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
GLTPD2A6NH11 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
GLTPD2A6NH11 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
GLTPD2A6NH11 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
GLTPD2A6NH11 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
GLTPD2A6NH11 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
GLTPD2A6NH11 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
GLTPD2A6NH11 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
GLTPD2A6NH11 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
GLTPD2A6NH11 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
GLTPD2A6NH11 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
GLTPD2A6NH11 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
GLTPD2A6NH11 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
GLTPD2A6NH11 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
GLTPD2A6NH11 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
GLTPD2A6NH11 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
GLTPD2A6NH11 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
GLTPD2A6NH11 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
GLTPD2A6NH11 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
GLTPD2A6NH11 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
GLTPD2A6NH11 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
GLTPD2A6NH11 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
GLTPD2A6NH11 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
GLTPD2A6NH11 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
GLTPD2A6NH11 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
GLTPD2A6NH11 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
GLTPD2A6NH11 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
GLTPD2A6NH11 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC33.34■■■□□ 2.93
GLTPD2A6NH11 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
GLTPD2A6NH11 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
GLTPD2A6NH11 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
GLTPD2A6NH11 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
GLTPD2A6NH11 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
GLTPD2A6NH11 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
GLTPD2A6NH11 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
GLTPD2A6NH11 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
GLTPD2A6NH11 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
GLTPD2A6NH11 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
GLTPD2A6NH11 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
GLTPD2A6NH11 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
GLTPD2A6NH11 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
GLTPD2A6NH11 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
GLTPD2A6NH11 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
GLTPD2A6NH11 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
GLTPD2A6NH11 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
GLTPD2A6NH11 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
GLTPD2A6NH11 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
GLTPD2A6NH11 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
GLTPD2A6NH11 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
GLTPD2A6NH11 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
GLTPD2A6NH11 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
GLTPD2A6NH11 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
GLTPD2A6NH11 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
GLTPD2A6NH11 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
GLTPD2A6NH11 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
GLTPD2A6NH11 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
GLTPD2A6NH11 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
GLTPD2A6NH11 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
GLTPD2A6NH11 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
GLTPD2A6NH11 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
GLTPD2A6NH11 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
GLTPD2A6NH11 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
GLTPD2A6NH11 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
GLTPD2A6NH11 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
GLTPD2A6NH11 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
GLTPD2A6NH11 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
GLTPD2A6NH11 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
GLTPD2A6NH11 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
GLTPD2A6NH11 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GLTPD2A6NH11 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms