Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRAMEF25A6NGN4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF25A6NGN4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF25A6NGN4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF25A6NGN4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF25A6NGN4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF25A6NGN4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF25A6NGN4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF25A6NGN4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF25A6NGN4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF25A6NGN4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF25A6NGN4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF25A6NGN4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF25A6NGN4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF25A6NGN4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF25A6NGN4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF25A6NGN4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF25A6NGN4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF25A6NGN4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF25A6NGN4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF25A6NGN4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF25A6NGN4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF25A6NGN4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRAMEF25A6NGN4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRAMEF25A6NGN4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRAMEF25A6NGN4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRAMEF25A6NGN4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRAMEF25A6NGN4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRAMEF25A6NGN4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRAMEF25A6NGN4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PRAMEF25A6NGN4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PRAMEF25A6NGN4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAMEF25A6NGN4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAMEF25A6NGN4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAMEF25A6NGN4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAMEF25A6NGN4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEF25A6NGN4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEF25A6NGN4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEF25A6NGN4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEF25A6NGN4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEF25A6NGN4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF25A6NGN4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF25A6NGN4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF25A6NGN4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF25A6NGN4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF25A6NGN4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF25A6NGN4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF25A6NGN4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF25A6NGN4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF25A6NGN4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF25A6NGN4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF25A6NGN4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF25A6NGN4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF25A6NGN4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF25A6NGN4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF25A6NGN4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF25A6NGN4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF25A6NGN4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEF25A6NGN4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEF25A6NGN4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEF25A6NGN4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEF25A6NGN4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEF25A6NGN4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEF25A6NGN4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEF25A6NGN4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF25A6NGN4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF25A6NGN4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF25A6NGN4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRAMEF25A6NGN4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRAMEF25A6NGN4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRAMEF25A6NGN4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRAMEF25A6NGN4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRAMEF25A6NGN4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PRAMEF25A6NGN4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF25A6NGN4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF25A6NGN4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEF25A6NGN4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEF25A6NGN4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEF25A6NGN4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEF25A6NGN4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF25A6NGN4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF25A6NGN4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF25A6NGN4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEF25A6NGN4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEF25A6NGN4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEF25A6NGN4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEF25A6NGN4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEF25A6NGN4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEF25A6NGN4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF25A6NGN4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF25A6NGN4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF25A6NGN4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PRAMEF25A6NGN4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRAMEF25A6NGN4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRAMEF25A6NGN4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRAMEF25A6NGN4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRAMEF25A6NGN4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF25A6NGN4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF25A6NGN4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF25A6NGN4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms