Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 GEMIN5-201ENST00000285873 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 KCNAB2-204ENST00000378083 4142 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 SUV39H1-201ENST00000337852 2978 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 SERPINA3-201ENST00000393078 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 PPT1-219ENST00000642050 4010 ntAPPRIS P2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 IKZF1-210ENST00000439701 3572 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AC008543.5-201ENST00000589227 2515 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 RBMY1F-202ENST00000454978 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 PAMR1-209ENST00000622144 2785 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 CSPG4P4Y-201ENST00000333235 3724 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 CSPG4P3Y-201ENST00000418188 3724 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 LINC00664-201ENST00000596203 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 ADGRG1-266ENST00000568908 3852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 Z94160.1-201ENST00000445088 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 HIST1H2BE-202ENST00000634910 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 MEMO1-201ENST00000295065 4505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 LMO7DN-201ENST00000318245 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 ZFYVE27-203ENST00000359980 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 IQCF4-203ENST00000428561 420 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AC009312.1-201ENST00000457110 592 ntTSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 SSSCA1-203ENST00000526877 713 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AP000911.1-205ENST00000527712 594 ntTSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AC073254.1-209ENST00000604677 631 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AC007450.4-201ENST00000614709 524 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AC244097.1-201ENST00000621631 1216 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 CR2-202ENST00000367058 4063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 RUNX1T1-202ENST00000360348 2370 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 WIPF1-204ENST00000392547 4587 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 ANKEF1-202ENST00000378392 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 ZNF540-210ENST00000592533 3147 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 CCDC144A-204ENST00000360524 5830 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 DNAJB8-202ENST00000469083 3365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 PDE4C-203ENST00000447275 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 KANSL1-208ENST00000574590 5147 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 RAB29-202ENST00000367139 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 ITSN1-211ENST00000399355 4003 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 GJB1-202ENST00000374022 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AC004847.1-201ENST00000568457 1911 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AC239800.2-201ENST00000443018 2675 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 ANXA11-205ENST00000438331 6965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 MIER1-207ENST00000371018 3875 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 CTCFL-209ENST00000433949 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 CXorf56-201ENST00000320339 2372 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 KLK2-201ENST00000325321 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 RMI2-202ENST00000572173 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 ZSCAN2-207ENST00000448803 3813 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 PSMG3-AS1-203ENST00000457484 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 SCHIP1-201ENST00000445224 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 Z95114.4-201ENST00000623420 3578 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 CHP1-201ENST00000334660 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 ZNF300-205ENST00000446148 3323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 OS9-202ENST00000315970 2691 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 MIR646HG-207ENST00000432910 2043 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 CEP70-208ENST00000474781 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 SLC22A8-205ENST00000535878 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AGGF1-201ENST00000312916 4509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 RCVRN-201ENST00000226193 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 TUBD1-202ENST00000340993 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 ZNF827-201ENST00000379448 4197 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 NRAV-201ENST00000500741 1901 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 LINC00910-201ENST00000341011 2303 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 PPARGC1B-204ENST00000403750 3146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 LOX-201ENST00000231004 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 SEMA6A-202ENST00000343348 6878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 RHBDL3-203ENST00000536287 4470 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 RNF150-206ENST00000515673 9805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 RNF144B-201ENST00000259939 5036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 CCDC144NL-AS1-216ENST00000582583 1670 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 ERI1-201ENST00000250263 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 CFDP1-201ENST00000283882 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 MYH9-202ENST00000401701 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AC020917.1-201ENST00000494084 893 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms