Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
A3GALT2U3KPV4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
A3GALT2U3KPV4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
A3GALT2U3KPV4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms