Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP15Q9Y4E8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
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