Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X8

UBE2D4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D4, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D4Q9Y2X8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.05■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2D4Q9Y2X8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBE2D4Q9Y2X8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBE2D4Q9Y2X8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms