Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COMMD8Q9NX08 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms