Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms