Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9C1

VIPAS39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPAS39Q9H9C1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
VIPAS39Q9H9C1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIPAS39Q9H9C1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms