Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0R5

GBP3, Guanylate-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP3Q9H0R5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBP3Q9H0R5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBP3Q9H0R5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBP3Q9H0R5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBP3Q9H0R5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP3Q9H0R5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP3Q9H0R5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP3Q9H0R5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP3Q9H0R5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP3Q9H0R5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP3Q9H0R5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP3Q9H0R5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP3Q9H0R5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP3Q9H0R5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP3Q9H0R5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP3Q9H0R5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP3Q9H0R5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP3Q9H0R5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP3Q9H0R5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP3Q9H0R5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP3Q9H0R5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP3Q9H0R5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP3Q9H0R5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP3Q9H0R5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP3Q9H0R5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP3Q9H0R5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP3Q9H0R5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP3Q9H0R5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP3Q9H0R5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP3Q9H0R5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP3Q9H0R5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP3Q9H0R5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP3Q9H0R5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP3Q9H0R5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP3Q9H0R5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP3Q9H0R5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP3Q9H0R5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP3Q9H0R5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP3Q9H0R5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP3Q9H0R5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP3Q9H0R5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP3Q9H0R5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP3Q9H0R5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP3Q9H0R5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP3Q9H0R5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP3Q9H0R5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP3Q9H0R5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP3Q9H0R5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP3Q9H0R5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms