Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP4Q9BWG4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms