Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG3

TRIM62, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM62, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM62Q9BVG3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM62Q9BVG3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms