Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms