Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE5

AGMAT, Agmatinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGMATQ9BSE5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AGMATQ9BSE5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AGMATQ9BSE5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AGMATQ9BSE5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
AGMATQ9BSE5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AGMATQ9BSE5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
AGMATQ9BSE5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
AGMATQ9BSE5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AGMATQ9BSE5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
AGMATQ9BSE5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AGMATQ9BSE5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
AGMATQ9BSE5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AGMATQ9BSE5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms