Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms