Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RGPD5Q99666 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RGPD5Q99666 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms