Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE7

MCEE, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCEEQ96PE7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCEEQ96PE7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms